Temporada
Episódio
- Episódio 1: O cerco, parte 3
- Episódio 2: O intruso
- Episódio 3: O corredor
- Episódio 4: Dueto
- Episódio 5: Condenados
- Episódio 6: A trindade
- Episódio 7: Instinto
- Episódio 8: Conversão
- Episódio 9: Aurora
- Episódio 10: Os garotos perdidos
- Episódio 11: A colméia
- Episódio 12: Epifania
- Episódio 13: Massa critica
- Episódio 14: Graça sob pressão
- Episódio 15: A torre
- Episódio 16: Um longo adeus
- Episódio 17: Golpe de estado
- Episódio 18: Michael
- Episódio 19: Inferno
- Episódio 20: Aliados
Stargate Atlantis Temporada 2 Inferno
Os acontecimentos em Stargate Atlantis seguem-se ao episódio final Lost City da sétima temporada de Stargate SG-1, no qual a equipa SG-1 encontrou um posto avançado na Antártida construído por uma raça conhecida como os Antigos (os Anciões). Com os desdobramentos em New Order, episódio inicial da oitava temporada de Stargate SG-1, o Comando Stargate envia uma equipa internacional para investigar o posto. O Dr. Jackson descobre a localização da mais grandiosa cidade criada pelos Antigos: Atlântida. A nova série acompanha as aventuras de um grupo de cientistas e militares que embarcam numa viagem sem volta para aquela cidade, na Galáxia Pégasus. Da mesma maneira que as equipas SG de Stargate SG-1, o uso, pela nova equipa, do Stargate coloca a humanidade em contacto com outras culturas, algumas humanas, outras alienígenas, algumas amigáveis, outras profundamente hostis, como os Wraith.
